1.直接ELISA
將抗原固定于ELISA板上，然后用酶標抗體直檢測抗原。
相較于其它類型的ELISA實驗，直接ELISA實驗步驟少，檢測速度快，不需要用到二抗，避免了交叉反應，測定結果不容易出錯。但是由于直接ELISA的抗原不是特異性固定的，樣本中的靶蛋白及其他雜質蛋白都會與ELISA板結合，實驗背景會比較高。而且直接ELISA每種靶蛋白都需要準備能夠與其特異性結合的一抗，實驗不太靈活。另外由于沒有使用二抗，信號沒有被放大，降低了測定的靈敏度。
2.間接ELISA
先將抗原結合到ELISA板上，隨后分兩步進行檢測：首先加入檢測抗體與抗原特異性結合，隨后加入酶標二抗檢測并利用底物顯色。
與直接ELISA相比，間接ELISA用到酶標二抗，具有更高的靈敏度，也需要更少的標記抗體，更經濟。間接ELISA還提供了更大的靈活性，因為不同的一抗能夠與單一標記的二抗一同使用。間接ELISA實驗的缺點是存在交叉反應的可能性（酶標二抗直接與抗原結合），可能會增加背景，同時與直接ELISA相比，間接ELISA實驗多了二抗孵育的步驟，實驗周期延長。
3.夾心ELISA
先將捕獲抗體固定于ELISA板孔中，然后加入樣品，接著加入檢測抗體。如果檢測抗體是酶標抗體，則可稱為直接夾心ELISA；如果檢測抗體不帶有標記，則還需要使用酶標二抗與檢測抗體結合，這種稱為間接夾心ELISA。
夾心ELISA的靈敏度高，它比直接或間接ELISA敏感2-5倍；同時夾心ELISA使用兩種特異性抗體與抗原結合，擁有很高的特異性。另外夾心ELISA能夠通過直接或間接的方式進行檢測，靈活性較高。夾心ELISA的缺點是對配對抗體要求很高，如果沒有標準化的試劑盒或者已經通過測試的配對抗體，則需要進行配對抗體定制并進行優化，因為降低捕獲抗體與檢測抗體之間的交叉反應是非常重要的。
4.競爭ELISA法
預先將抗原包被在固相載體上，并加入酶標記的特異性抗體。實驗時，加入待檢抗原（或抗體），如果待檢物是抗原，則待檢抗原與預先包被在固相載體上的抗原競爭結合酶標抗體；如果待檢測物是抗體，則待檢抗體就與系統中原有的酶標抗體競爭結合包被在固相載體上的抗原。通過洗滌洗掉被競爭結合的酶標抗體，最后加底物顯色。需要注意的是顯色結果與待檢抗原（或抗體）的量成反比。
競爭ELISA相對以上介紹的三種方法更復雜一些，但以上三種ELISA類型都適用于競爭ELISA的形式。其主要優點在于可檢測不純的樣品，且數據再現性高，但存在整體敏感性和專一性較差的問題。
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